Il municipio fu eretto in questo luogo nel XIV secolo, ben lontano dalla sede del Signore di allora, il Vescovo-principe, che risiedeva sulla collina della cattedrale. Questa separazione geografica dimostra che la borghesia di allora, rinforzatasi economicamente, voleva l’indipendenza dal vescovo. Furono peraltro gli artigiani, organizzati in 15 corporazioni, a imporre nel 1501 l’adesione della città di Basilea alla Lega dei Confederati. In quell’occasione, all’inizio del XVI secolo, si sostituì la parte che si affacciava sulla piazza con una costruzione più rappresentativa. Sui merli si apposero gli stemmi dei 12 cantoni che, assieme a Basilea, all’epoca formavano la Confederazione.

All’inizio del XVII secolo, il municipio fu ingrandito e la facciata fu decorata con trompe-l’oeil architettonici di Hans Bock. Nel 1900 si aggiunse al corpo centrale l’ala sinistra e la torre destra. Nello stesso periodo si demolì e sostituì anche la parte posteriore risalente al XIV secolo.