La storia del Convento di S. Giovanni a Müstair risale a 1200 anni fa, all'epoca di Carlo Magno. Nell'800, il re di Franconia fu nominato imperatore da Papa Leone III e incoronato come primo sovrano medievale d'Occidente. La tradizione locale in base alla quale, negli anni 780–90, Carlo Magno fondò il convento, è stata confermata dalle più recenti ricerche archeologiche e la data dendrocronoligica risalente al 775.

S. Giovanni, riservato ai monaci ai tempi della sua fondazione, fu trasformato nel 12° secolo in un convento femminile, abitato ancora oggi da suore benedettine.