L'histoire du couvent Saint-Jean à Müstair remonte à plus de 1200 ans - et donc à l'époque de Charlemagne. Le roi des Francs a été sacré empereur en l'an 800 par le pape Léon III et fut ainsi le premier souverain médiéval d'Occident. La tradition locale, selon laquelle le couvent aurait été fondé dans les années 780-790 par Charlemagne lui-même, est confirmée par les dernières recherches archéologiques et la dendrochronologie qui le date à 775.

Saint-Jean, qui était à l'origine un monastère, a été transformé au 12e siècle en couvent pour femmes. Il accueille aujourd'hui encore des sœurs bénédictines.