Depuis le 14e siècle, l‘hôtel de ville se trouve à cet endroit, loin de la résidence de l‘ancien seigneur de la ville, le prince-évêque, sur la colline de la cathédrale. Cette séparation démontre que la bourgeoisie, avec sa position économique renforcée, aspirait à l‘indépendance vis-à-vis de l‘évêque. Les artisans organisés en 15 corporations en 1501 réussirent à imposer l‘entrée de la ville de Bâle dans la Confédération Suisse. Pour cette occasion on remplaça au début du 16e siècle la partie du bâtiment donnant sur la place par un nouvel édifice. Sur les créneaux on apposa les écussons des 12 cantons qui à l‘époque constituaient la confédération avec Bâle.

Au début du 17eme siècle, l‘hôtel de ville fut agrandi et la façade élargie fut décorée par Hans Bock avec une architecture en trompe-l‘œil. En 1900, le Rathaus fut encore agrandi avec l‘aile tout à gauche et le beffroi à droite. C‘est à ce moment-là aussi que fut démolie l‘ancienne partie arrière et remplacée par une nouvelle.