La chapelle des grâces de Marie «im Stein» (dans le rocher), située 59 marches sous l'église de l'abbaye, au cœur d'une grotte, date du 15e siècle et attire depuis lors des pèlerins qui vénèrent ici la Vierge Marie en tant que Vierge souriante. La légende raconte que la chapelle fut construite à l'endroit où un enfant survécut de façon miraculeuse à l'effondrement d'une falaise. L'abbaye et l'église sont construites plus tard, en 1648, à l'occasion du transfert de l'Ordre bénédictin de Beinwil à Mariastein. Aujourd'hui, l'église se caractérise surtout par sa façade principale néo-classique en calcaire jurassique avec des pierres ornementales et dont la construction date de 1834.

Au cours du Kulturkampf, l'abbaye de Mariastein est supprimée par votation populaire en 1874 et les moines vont s'établir en France, à Delle. Près de 100 ans plus tard, une nouvelle votation populaire rétablit officiellement l'abbaye dans ses droits. Les bâtisses architecturales ont récemment fait l'objet d'une vaste rénovation et sont en excellent état. Aujourd'hui, le fonctionnement de l'abbaye est assuré par une confrérie active de bénédictins qui accueille les pèlerins ainsi que des hôtes du monde entier. L'abbaye ou les auberges historiques dans les environs, qui hébergent et restaurent les pèlerins depuis des siècles, proposent aux randonneurs une atmosphère de lieu de pèlerinage unique.