Vers 1500, un chercheur d’or néerlandais aurait eu une apparition dans les environs. La chapelle qui y fut érigée en 1518 ne résista pas à l’affluence des pèlerins et fut démolie. Sauvée de la fureur des iconoclastes de la Réforme, une image sainte en provenance de Frybach, dans le canton de Berne, fut à l’origine des pèlerinages à Werthenstein. L’église actuelle a été construite en 1608 et la construction du monastère franciscain devant prendre en charge la foule des pèlerins dura jusqu’en 1636. À l’apogée du pèlerinage, aux 17ème/18ème siècles, plusieurs milliers de pèlerins se rendaient chaque année à Werthenstein - y apportant un peu de prospérité. Avec les randonneurs et pèlerins du chemin de Compostelle parcourant cette route, le nombre de pèlerins recommence à croitre aujourd’hui; Werthenstein est à nouveau un lieu d’étape pour pèlerins, mais également pour les amateurs de mouvement au cours des tours qu'ils entreprennent durant leurs loisirs.

La prospérité relative due aux revenus engendrés par les pèlerins constitua la condition préalable à la fusion de Werthenstein avec ses communes voisines appauvries de Wolhusen-Markt (1854) et Schachen (1889). Les frontières en sont donc déconcertantes: tandis que la moitié du village voisin de Wolhusen appartient au territoire communal de Wertherstein, à l’inverse, Werthenstein-Unterdorf appartient à Ruswil. Ceci n’a pas lieu de gêner les visiteurs et les pèlerins. À côté de l’église de pèlerinage, de nombreuses autres chapelles ainsi que le vieux pont de bois «Emme-Holzbrücke», datant de 1710, au pied de la colline du monastère, comptent également parmi les curiosités. De plus, Werthenstein se trouve aux portes de la biosphère «UNESCO Biosphäre Entlebuch».