Seit dem Gründungsjahr 1954 wurde eine einzigartige Sammlung von Objekten und Dokumenten in Zusammenhang mit dem See und Wasser zusammengetragen - sowohl auf dem Gebiet der Natur als auch der Kultur. Besonders bemerkenswert ist die Sammlung zur Schifffahrt mit mehr als 30 erhaltenen Booten und über 150 Modellen.

Das Genfersee-Museum macht aber auch auf heutige Herausforderungen aufmerksam: die Bekämpfung der Umweltverschmutzung, die Bewahrung von Fauna und Flora und die Wasserqualität des Sees.